（1）加強生物相觀(guān)察
在正常運行和生物膜降解能力良好時(shí)，生物膜上的生物相相對穩定，細菌和原生動(dòng)物之間存在著(zhù)制約關(guān)系。
在運行過(guò)程中，若有機物負荷或營(yíng)養狀況有較大變化，則原生動(dòng)物中固著(zhù)性鐘蟲(chóng)、枝蟲(chóng)消失，絲狀菌稀少，菌膠團結構松散，而游泳性草履蟲(chóng)、鐘蟲(chóng)大量出現，出水水質(zhì)變差。
反之，若原來(lái)出水水質(zhì)較差，一旦出現鐘蟲(chóng)、枝蟲(chóng)、絲狀菌，菌膠團結構緊密，而游泳性草履蟲(chóng)、鐘蟲(chóng)減少，則說(shuō)明環(huán)境條件有了改善，出水水質(zhì)變好。因此原生動(dòng)物纖毛蟲(chóng)，特別是鐘蟲(chóng)、枝蟲(chóng)是生物接觸氧化系統運轉良好的有價(jià)值的指示性生物。
（2）控制進(jìn)水pH值
影響生物接觸氧化池正常運轉的因素主要有溫度、pH值、溶解氧和營(yíng)養物。pH值較易測定，對于pH值過(guò)高或過(guò)低的廢水，要進(jìn)行pH值的調節處理，控制生物接觸氧化池pH值在6.5-9.5之間。否則，氧化池中微生物易受損害，影響生物相和處理效果。
（3）防止填料的堵塞
防止填料堵塞除在設計過(guò)程中選擇適宜的填料外，在運行過(guò)程應定時(shí)加大氣量對填料進(jìn)行反沖洗，通常是15~20d反沖洗一次，每次反沖洗30分鐘左右。這對于填料上衰老生物膜的脫落，促進(jìn)生物膜的新陳代謝，防止填料堵塞很有效。
